Le 17 septembre 1562, il rédigea les statuts fondateurs, précisant clairement dans la première des clauses la paternité par Andrés de Vandelvira de l'ensemble du projet: «Tout d'abord, nous ordonnons que ladite maison et cet hôpital soient terminés conformément à l'ordre et trace qu'Andrés de Vandelvira, maître tailleur de pierre, a donné, selon laquelle ledit travail a commencé (...) ». Les fonctions de ce grand groupe sont diverses et sont liées à la vie et à l'œuvre de son fondateur. En premier lieu, c'est un hôpital pour les patients atteints de «bubas» (plus tard, l'aide à d'autres maladies a été élargie); deuxièmement, une chapelle pour le culte divin, qui doit être construite "(...) selon le schéma donné par le dicton Andrés de Vandelvira, maître tailleur de pierre (...)". Troisièmement, l'enterrement "(...) Partout où notre corps est enterré et amené d'où il voudrait que nous mourions (...)"; mais aussi certaines chambres seraient réservées à sa résidence privée dans l'aile est.

Le bâtiment devait abriter tous les types de personnel destinés à l'entretien sanitaire et spirituel. Construit sur un grand site à l'extérieur des murs, comme cela était obligatoire pour ces travaux de santé à grande échelle, à proximité de l'ermitage de San Lázaro et, par conséquent, à l'entrée d'Úbeda depuis Baeza. Cet hôpital, comme beaucoup d'autres construits au XVIe siècle en Espagne, en raison de son énorme monumentalité, était destiné à devenir un pôle urbain incontestable dans l'expansion hors de la ville d'Úbeda. En effet, c'est actuellement l'un des monuments architecturaux et culturels les plus importants de la ville.

La construction débuta avant 1562, mais pour des raisons inconnues, les travaux furent interrompus pendant près de deux ans, pour se poursuivre à la fin de 1564 et ne s'arrêter qu'à son achèvement en 1575, dix ans après la mort de son fondateur. Sa grande façade, articulée sur deux étages, est de conception paysagère et extrêmement sobre; Elle est précédée d'un large marché élevé au-dessus de la route orné de quatre épaisses colonnes doriques avec des lions assis dessus qui soutiennent le bouclier du fondateur. Le portail d'entrée, avec un relief représentant un Santiago Matamoros, et deux grandes tours aux extrémités sans fonction apparente, terminent de façon monumentale le complexe de ce côté sud, laissant le reste des côtés parfaitement isolé de l'extérieur par de hauts murs et dépendances. La cour centrale, à la manière des palais, est articulée de doubles pandas sur ses quatre côtés constitués de cinq arcs en demi-cercle abaissés sur d'élégantes colonnes de marbre blanc de l'ordre corinthien. Le grand escalier est couvert d'une superbe voûte ornée d'un vaste programme iconographique dans lequel, entre autres figures, sont représentées des effigies de rois hispaniques, d'Alphonse VIII à Felipe II; sur le devant, il y a un grand bouclier de Don Diego de los Cobos. Sur les côtés de cette cour centrale, orientée vers les espaces extérieurs clôturés, il y a deux cours secondaires en colonnes, également avec une disposition élégante.

L'église s'ouvre sur le patio à travers trois grands et beaux bars, sculptés entre 1573 et 1575 par le maître Ubeta Juan Álvarez de Molina, selon un projet Vandelvira. C'est la pièce la plus innovante et loin de ce qui a été fait jusqu'à présent dans ce type d'espaces ecclésiastiques. Ici, Andrés de Vandelvira conçoit une forme inhabituelle dans sa production. Un grand rectangle, avec deux tours en son centre, qui deviennent intérieurement des tribunes et qui à leur tour donnent naissance à deux autres rectangles séparés par ces corps volumétriques. Le résultat est un plan d'étage original en forme de «H» avec la chapelle principale mise en évidence, l'espace central étant couvert de voûtes abaissées et les chapelles latérales avec des voûtes en demi-berceau. Les voûtes de la partie centrale sont ornées de fresques peintes à la fin du XVIe siècle par Pedro de Raxis et Gabriel de Rosales, qui étaient également auteurs de la décoration de la sacristie et de l'anti-église.

Avec cet ensemble monumental, Andrés de Vandelvira termine d'une manière extraordinaire la série d'interventions menées dans la ville d'Úbeda, étant en tout cas l'une de ses œuvres les plus remarquables et l'un des plus beaux exemples de l'architecture hospitalière espagnole du XVIe siècle.

AUTRES MANIFESTATIONS ARTISTIQUES NON ARCHITECTURALES

L'ensemble architectural de cet hôpital était orné d'œuvres d'art importantes (peintures, stalles, bars, retables, etc.), qui ont été partiellement conservées à ce jour. Les trois barres qui ferment les arcades d'accès à l'église restent toujours en place, à travers lesquelles et depuis la cour d'honneur les fidèles pouvaient prier ou visualiser son intérieur. En 1573, le rejero Juan Álvarez de Molina a confié la fabrication des trois barres selon l'échantillon et les conditions réalisés par Andrés de Vandelvira, responsable des travaux architecturaux, mais aussi d'une bonne partie des travaux décoratifs. On sait que Vandelvira était un bon connaisseur et concepteur de la technique de la clôture. Domínguez Cubero estime que "(... la grille Renaissance de Jaén est née par Úbeda et précisément à cause des dessins d'Andrés de Vandelvira ...)".

Le programme pictural de fresques développé dans la grande cage d'escalier, l'église, la pré-église et la sacristie a été d'une grande importance tout au long du dernier quart du XVIe siècle, tous attribués aux peintres Gabriel Rosales et Pedro de Raxis. Évêques, vierges, rois d'Espagne, grand bouclier du fondateur Diego de los Cobos, etc. dans l'antécristie, les prophètes, les Atlantes et les cariatides; dans la sacristie des dieux olympiens, des pères de l'Église, fondateurs d'ordres religieux et de boucliers héraldiques; dans l'église, le châtiment d'Adam et Eve, la mort d'Abel et l'imitation de billes et de cartouches avec épigraphie; dans le sous-sol le péché originel et l'expulsion du paradis. Le grand retable (détruit entre autres meubles en 1936) a été sculpté par Blas Briñón et Luis de Zayas, avec dorure et peinture des peintres Rosales et Rajis. De Rajis est la toile d'un Santiago Matamoros accroché dans la chapelle du côté de l'épître. Briñon a également sculpté les stalles, dont les restes recomposés - comme un retable - peuvent être admirés dans la chapelle principale.